厭氧發(fā)酵的4個基本過程可分為水解過程、發(fā)酵過程、產氫產乙酸過程和產甲烷過程，按基本過程的劃分厭氧發(fā)酵的基本理論可以分為二階段理論、三階段理論和四階段理論。

　　一、二階段理論

　　二階段理論包括酸性發(fā)酵階段和甲烷發(fā)酵階段，酸性發(fā)酵階段是厭氧酸性發(fā)酵細菌將大分子有機物分解成小分子中間產物如二氧化碳、氫氣、羧酸類和醇類等。在甲烷發(fā)酵階段，酸性發(fā)酵階段產生的中間產物在產甲烷菌的作用下轉化成甲烷。

　　二、三階段理論

　　三階段理論比二階段理論多了一個水解發(fā)酵階段，在這個階段，專性厭氧菌和兼性厭氧菌把復雜的有機物分解成較為簡單的有機物，如纖維素分解成簡單的糖類，蛋白質分解成氨基酸，脂類分解成脂肪酸和甘油等。然后產酸菌把這些簡單有機物分解成乙酸、丙酸、丁酸等脂肪酸和醇類等。

　　三、四階段理論

　　四階段理論就是把三階段理論的水解發(fā)酵階段分成兩步，四階段包括復雜有機物分解成簡單有機物的水解階段、簡單有機物發(fā)酵生成揮發(fā)性脂肪酸和醇類的發(fā)酵階段、中間產物進一步轉化為乙酸和氫氣的產氫產乙酸階段、乙酸和氫氣轉化為甲烷的產甲烷階段。